Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PlnP61014 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PlnP61014 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PlnP61014 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PlnP61014 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PlnP61014 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PlnP61014 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PlnP61014 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PlnP61014 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PlnP61014 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms