Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcbp1P60335 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms