Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pdrg1P59048 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pdrg1P59048 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pdrg1P59048 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pdrg1P59048 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms