Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms