Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tm9sf2P58021 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf2P58021 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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