Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lim2P56563 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lim2P56563 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms