Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1bbP56400 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms