Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms