Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms