Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Map3k1P53349 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms