Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LtbrP50284 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbrP50284 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms