Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb42P49222 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb42P49222 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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