Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LmnaP48678 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LmnaP48678 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms