Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prox1P48437 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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