Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rfx2P48379 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rfx2P48379 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rfx2P48379 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rfx2P48379 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rfx2P48379 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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