Protein–RNA interactions for Protein: P47964

Rpl36, 60S ribosomal protein L36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36P47964 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl36P47964 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl36P47964 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl36P47964 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl36P47964 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl36P47964 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl36P47964 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl36P47964 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms