Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf5P43027 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms