Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkx1-2P42580 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkx1-2P42580 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms