Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms