Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TfamP40630 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TfamP40630 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms