Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf2P39429 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf2P39429 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf2P39429 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf2P39429 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms