Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf1P39428 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf1P39428 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms