Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms