Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms