Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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