Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprmP28828 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprmP28828 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprmP28828 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprmP28828 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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