Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChgaP26339 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms