Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms