Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZfaP23607 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZfaP23607 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms