Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a2P20490 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms