Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VimP20152 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VimP20152 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VimP20152 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VimP20152 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms