Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd44P15379 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms