Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms