Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms