Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tnp2P11378 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms