Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P10404 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P10404 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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P10404 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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P10404 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P10404 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P10404 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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