Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms