Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms