Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms