Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TnfP06804 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TnfP06804 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TnfP06804 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TnfP06804 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TnfP06804 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TnfP06804 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms