Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01678 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01678 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01678 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01678 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01678 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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