Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01653 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01653 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01653 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01653 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01653 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms