Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnkO88874 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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