Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hcn3O88705 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hcn3O88705 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hcn3O88705 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hcn3O88705 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hcn3O88705 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcn3O88705 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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