Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ClppO88696 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ClppO88696 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClppO88696 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClppO88696 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClppO88696 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClppO88696 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ClppO88696 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ClppO88696 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms