Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb5O70309 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms