Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3dO70194 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms