Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr1O55100 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms