Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn5O54942 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms