Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EomesO54839 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EomesO54839 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EomesO54839 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EomesO54839 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EomesO54839 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EomesO54839 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EomesO54839 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EomesO54839 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EomesO54839 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EomesO54839 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EomesO54839 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EomesO54839 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EomesO54839 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EomesO54839 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EomesO54839 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms